Face aux enjeux environnementaux, alimentaires et énergétiques, de profonds changements de paradigmes doivent être amorcés par les sociétés.

L’unité AGHYLE évolue dans un contexte scientifique axé sur l’étude des interactions entre les plantes, les sols, l’eau et la diversité biologique, en réponse aux enjeux actuels de la transition agroécologique.

Ses recherches visent à comprendre les processus biologiques, physico-chimiques et écologiques impliqués dans la santé des sols, la nutrition des plantes, la productivité des cultures et la résilience des agroécosystèmes face aux stress biotiques et abiotiques.

Ce cadre s’inscrit dans des politiques publiques ambitieuses : 

  • réduction des intrants chimiques,
  • amélioration de la qualité des sols et de l’eau,
  • préservation de la biodiversité
  • adaptation au changement climatique. 

L’unité AGHYLE développe ainsi une approche systémique et multi-échelle de l’agriculture durable.

Schéma de la zone critique (d’après Chorover et al., 2007)

* Schéma de la zone critique (d’après Chorover et al., 2007)

logo AGHYLE

 

Les enjeux de l'unité AGHYLE

L’unité AGHYLE se positionne sur plusieurs enjeux majeurs :

  • Soutien aux transitions agricoles : par l’identification et la diffusion de pratiques agricoles innovantes favorisant la santé des sols, la réduction des produits phytosanitaires et l’optimisation de la fertilisation.
  • Contribution à l’innovation scientifique : à travers le développement de biosolutions, de modèles prédictifs et d’outils de caractérisation des sols, de la rhizosphère et des transferts environnementaux.
  • Formation et encadrement : forte implication dans la formation initiale (élèves ingénieurs), la formation par la recherche (masters, thèses, postdocs), et la formation continue des acteurs du monde agricole et environnemental.

Le projet scientifique

Le projet scientifique de l’unité AGHYLE est structuré autour de trois grands axes thématiques complémentaires :

  • Axe 1 : Sols, biodiversité et services écosystémiques
  • Axe 2 : Sols, biodiversité et santé des plantes
  • Axe 3 : Sols, biodiversité et santé globale
     
Schéma explicatif - unité AGHYLE

L'unité AGHYLE

L’unité AGHYLE est un acteur clé de la recherche agronomique et environnementale, spécialisée dans l’étude des interactions sols-plantes-microorganismes et la modélisation des transferts dans les agroécosystèmes.

Elle joue un rôle central dans l’accompagnement des transitions agricoles vers des pratiques plus durables, au croisement de l’innovation scientifique, de la formation d’ingénieurs, et des partenariats socio-économiques. 

Son expertise repose sur une approche multidisciplinaire, des expérimentations en plein champ, et une volonté forte de transférer les connaissances vers les filières agricoles et les politiques publiques.

L'équipe

AGHYLE Campus de Beauvais

AGHYLE Campus de Rouen

  • Maroua ALAOUI - « Contribution à la compréhension des interactions plantes / microorganismes du sol : étude de la rhizodéposition de microARN chez le blé, colza et pois sous contraintes abiotiques. » - Thèse soutenue le 2 décembre 2025
  • Charlotte AMY – « Optimisation de la disponibilité du Phosphore du sol par des biointrants (biofertilisant) : impacts sur l’Efficience d’usage des fertilisants azotés et le Rendement chez le colzA » - Thèse soutenue le 17 décembre 2021
  • Sylvie ASSAGBA – « Biostimulants & Efficience Azotée en Agroécosystèmes »
  • Maëva BICARD –  « Intégration des modèles écophysiologiques en amélioration des plantes. Identification et caractérisation des facteurs environnementaux impliqués dans les interactions génotypes/environnement chez l’orge de printemps »  - Thèse soutenue le 1er février 2024
  • Mathilde CAMIADE –  « Impacts sanitaire et écologique de l’adaptation de bactéries pathogènes entériques aux végétaux »  – Thèse soutenue le 9 Juillet 2019
  • Amandine CHEVALIER – « Optimisation des procédés de production de lombricompost pour en valoriser le potentiel microbiologique au bénéfice de la santé des plantes et du sol »
  • Joël KODZO DROPENOU – « Comprendre les interactions génotype x environnement pour améliorer et stabiliser le rendement et la qualité du blé tendre »
  • Chloé ELMERICH – « Étude des interactions génotype x environnement pour l'adaptation et l'amélioration du soja en Europe » – Thèse soutenue le 10 novembre 2023
  • Matthieu FORSTER –  « Root traits effect on soil traffic-induced shear in agroecosystems » - Thèse soutenue le 20 novembre 2020
  • Florian GENDREAU – « Développement et validation de modèles permettant la découverte de bioactifs innovants pour lutter contre des maladies des cultures »
  • Mohamed El Aziz HAFSIA – « Conception d’un jumeau numérique du sol, en combinant des approches mécanistes et statistiques de modélisation »
  • Salma HAMMAMI – «  Evaluation des risques morpho-hydrologiques et impact sur l’aménagement : Grand Tunis »
  • Nicolas HONVAULT – « Effet de la diversité fonctionnelle des cultures intermédiaires sur la disponibilité du phosphore dans les sols » - Thèse soutenue le 18 novembre 2020
  • Mohamed KANTE – « Impact de la rhizodéposition C et N par les Fabacées à graines et les Fabacées fourragères sur les  communautés microbiennes édaphiques et sur la dynamique du carbone, de l’azote et du phosphore dans le sol » - Thèse soutenue le 13 juillet 2022
  • Haiyan LIU - Thèse soutenue le 10 mai 2018
  • Pauline LUSLEY – « Caractérisation de mécanismes directs et indirects de résistance à la pourriture racinaire du pois induite par Aphanomyces euteiches. Influence des choix variétaux et des microorganismes bénéfiques de la rhizosphère » - Thèse soutenue le 16 octobre 2020
  • Anouk LYVER – « Rôle des interactions plantes, microorganismes et sol sur les voies d'incorporation de résidus de culture dans la matière organique du sol » - Thèse soutenue le 15 décembre 2025
  • Fida MRAD - « Décomposition de résidus de culture et de matériaux biosourcés : impacts sur les communautés microbiennes des sols agricoles et les fonctions associées » – Thèse soutenue le 18 décembre 2018
  • Aline PLANCHON – « Ecoproduction et valorisation du lin: écoproduction contre Fusarium oxysporum et impact sur les propriétés des agromatériaux » – Thèse soutenue le 18 décembre 2018
  • Julia QUEIROS  – « Étude de l’impact de l’application de paille de colza torréfiée sur le fonctionnement du sol, les communautés microbiennes et la dynamique des éléments nutritifs au sein du système sol-plante »
  • Cyrine REZGUI – « Dynamique de l’Azote issu de la culture de pois d’hiver dans la rotation » - Thèse soutenue le 11 décembre 2020
  • Erika SAMAIN – « Etude des interactions PGPRs/génotypes de blé tendre dans la lutte contre la septoriose » - Thèse soutenue le 18 Juin 2019
  • Viviane SCHELL – « Améliorer l'association en relais céréale hiver/soja par l'étude de la compétition subie par le soja et son évaluation agro-environnementale » - Thèse soutenue le 8 avril 2024
  • Dhekra SOUISSI – « Cartographie de la recharge potentielle dans les zones arides » - Thèse soutenue le 14 décembre 2019
  • Alicia VEIGA – « Développement d'un modèle de prise de décision sur le réglage instantané du semoir à partir de données embarquées du sol pour une amélioration du semis des cultures de printemps »
  • Angel VELASCO SANCHEZ - Campus de Rouen « Impact of reflow fertilizers on soil microbial communities diversity and functions » - Thèse soutenue le 26 juin 2024

Les projets de recherche

Acronyme

Nom du projet

Année

Axe

Référent

Partenaires

Financeur

Breed-Epeautre-OmicsApproche génomique de l'épeautre pour une agriculture durable face au réchauffement climatique2026-2029Axe 2Eduardo D. MUNAIZ 

FEADER

MiningBrinesMultidisciplinary Integration and Networking for Increased sustainability and multi-resources valorization of Geothermal Brines2026-2029Axe 1Olivier POURRETCNRS, BRGM, HELMHOLTZ ZENTRUM POTSDAM DEUTSCHESMSCA
Agriloop 2025-2026Axe 1Stephane FIRMIN / Julien GUIDETVCM Mestverwerking

INTERREG

POTIONEvaluation du potentiel d'introduction de légumineuses à graines tropicales dans le nord de la France2025-2028Axe 2Alicia AYERDI GOTORUniversité de Caen

FEADER

AESTRAAide à l’évaluation stratégique pour l’intégration de préparations naturelles fabriquées à la ferme2024-2027Axe 1Anne Maïmiti DULAURENTPériG, CerFrance, Gässler SAS, Lycée agricole Airion, UPJV 

FEADER

 

DEFILEGDéveloppement des filières de légumineuses pois & féverole en région Grand Nord  2023-2027Axe 1Wassila RIAHUniLaSalle, Natup innovation, Cerfrance, Université de Rouen, RAGT2N

FEADER

 

LIVETLivestock farming and One Health2022-2025Axe 3Nadia LAURENTDipartimento di Scienze Agrarie, Alimentari e Ambientali (Université de Perugia)
CESAR Umbria
Chambres d’agriculture de Normandie
DEULA Nienburg GmbH
Zemnieku Saeima
Universitatea de Științe Agricole și Medicină Veterinară Cluj-Napoca
Lietuvos Respublikos Žemės Ūkio Rūmai (Chambre d’agriculture de Lituanie)
LBTU – Latvijas Biozinātņu un Tehnoloģiju Universitāte
Aukštaitijos profesinio rengimo centras

ERASMUS

 

BIOAUXILRéduction de l’usage des insecticides en grandes cultures par la biodiversité fonctionnelle2021-2024Axe 1Anne Maïmiti DULAURENTPériG, UPJV, ITB, Fredon 

FEADER

 

SMNSoja Made in Normandie2020-2023Axe 2Mélanie BRESSANINRA-UNICAEN , Université de Rouen; Terres Inovia; la CRAN; Agrial; Coop de Creully, Agrauxine

 

FEDER

 

PROVEGProtéines végétales2020-2022Axe 1Wassila RIAHUniversité de Rouen , CERFRANCE Normandie Maine, NATUP

FEDER

 

AcronymeNom du projetAnnéeAxeRéférentPartenairesFinanceur
LIEN du SOLCaractérisation du lien entre bioindicateurs et fonctions du sol pour un conseil opérationnel2025-2028Axe 1Wassila RIAH / Nadia LAURENTARVALIS – AUREA Agrosciences – Celesta‑lab – INRAE – UniLaSalle ,Terres Inovia – Chambre Régionale d’Agriculture de Bretagne – Chambre d’Agriculture d’Alsace CASDAR
TAUPIFAST2Fédérer et accompagner la recherche de solutions techniques innovantes pour protéger les cultures contre les taupins 2025-2028Axe 2Thomas DAMESTOYinov3PT, CTIFL, Arvalis, INRAE/IGEPP, Genotoul/Metatoul, CNRS, Sileban, ACPEL, Terre d'essais, CEFELPARSADA
MAMBOModélisation moléculaire pour optimiser et développer des outils d'évaluation des bio-solutions pour la santé des sols et des plantes2025-2028Axe 2Mélanie BRESSAN / Mathilde BOUTEILLERINRAe, CNRS, Akinao, Imean, My training boxFrance 2030
ADOPTPromouvoir des trajectoires d’adoption et de maintien de pratiques de protection des cultures basées sur la diversification des cultures associées à des trajectoires durables de régulation des bioagresseurs2025-2027Axe 1 / Axe 3Isabelle GATTININRAE, ENS, CNRS, IEES, Dauphine, Université de Rouen , Université de Nîmes, Collectivité territoriale de RouenPlan Écophyto II+
TANGGOTransmettre l’agroécologie aux nouvelles générations avec les groupes2025-2028Axe 1Wassila RIAH CASDAR
TwinFARMSDéployer des jumeaux numériques à l’échelle de l’exploitation agricole pour favoriser l’innovation agroécologique2024-2028Axe 1Jérôme DANTAN / Isabelle GATTIN / Wassila RIAHAgroParisTech – Télécom Paris – UniLaSalle – INRAE – Arvalis – Institut du Végétal – Fondation AgroParisTech (FAPT) – AgroParisTech Innovation (APTI) – ACTA – IDELE – IFIP – ITAVI – Terres Inovia – AgreenTech Valley – Cooperl Innovation – Exxact RoboticsPEPR AGROECONIUM
ARPEGEDéveloppement de filières vertueuses ciblées dans une démarche d’agriculture régénérative2024-2027Axe 1Wassila RIAH / Mélanie BRESSANAXEREAL, FertiBerry semences, Genesis, Axa Climate, Medinbio, Hommes et Territoires, Terres Inovia et UniLaSalleFrance 2030 BPI
INSEREZ-LESInsertion réussie des légumineuses à graines dans les systèmes alimentaires et de culture2024-2027Axe 1Wassila RIAHUniversité de Montpellier – CTCPA – Terres Inovia – INRAE – Institut Agro Dijon – UMR QualiSud – GEVES – UniLaSalle – EARL Lacour BrouetFrance 2030 ANR
RAPETORRDéveloppement d'une filière innovante d’amendement, defertilisation et de stockage du carbone dans les sols à destination des agriculteurs2023-2027Axe 1David HOUBENAvril, Sorbonne Université CNRSADEME
SOYSTAINABLEVers une source de protéines de soja local et responsable en alimentation humaine résiliente au changement climatique2023-2028Axe 2Bastien LANGE ANR
COQCLIM  Axe 2Babacar THIOYESYNDICAT de producteurs FRANCE PISTACHE
SYNDICAT des producteurs d’AMANDES DE PROVENCE
CHAMBRE RÉGIONALE D’AGRICULTURE PACA
CHAMBRE D’AGRICULTURE de Vaucluse
Station d’expérimentation LA PUGÈRE
Entreprise TARNAGAS
INSTITUT AGRO Montpellier
Centre CRIIAM SUD
COMPAGNIE DES AMANDES
SARL Lambertin G&L (PEPINIERES DU SOLEIL)
COULIE PLANTS
CASDAR

AcronymeNom du projetAnnéeAxeRéférentPartenairesFinanceur
PHYSPOTExploration du microbiote de la phylloshère et de ses fonction, applications pour améliorer la santé de la pomme de terre​2025-2027Axe 2Mathilde BOUTEILLER CR Normandie
MICROPOLDégradation chimique et physique du Chloridazone pour le traitement des micropolluants dans l'eau2024-2027Axe 2Stéphane FIRMINUniLaSalle, UTC, ULCO, Université de LilleRégion Hauts-de-France
PACLEGAugmenter l’accumulation du carbone organique dans les sols agricoles2023-2025Axe 1Murilo VELOSO CR Normandie
MYC'UPValorisation zéro résidu du support de pousse ligno-cellulosique de champignons comestibles : utilisation en biocontrôle et bio-stimulation 2023-2025Axe 2Sameh SELIMULCO , Université d'ArtoisRégion Hauts-de-France

AcronymeNom du projetAnnéeAxeRéférentPartenairesFinanceur
AgroBiotechChangement climatique et processus d'interaction entre les plantes et leur environnement biotique et abiotique2023-2026Axe 1 / Axe 2 / Axe 3Isabelle GATTIN Région Normandie
CPER BiHauts Eco de FranceDispositif de phénotypage in situ du système sol-plante 2021-2027Axe 1 / Axe 2Michel-Pierre FAUCON 

Etat - Région Hauts de France - FEDER

RPTRoot Plant Technology2020-2022Axe 1 / Axe 2Isabelle GATTIN 

FEDER - Région Normandie

Normandie Plant TechnologyPhénotypage aérien plateforme Normandie végétal 2018-2021Axe 1 / Axe 2Isabelle GATTIN Région Normandie

Réseaux de recherche

Cette Structure Fédérative labellisée en 2017 par le Ministère de l’Enseignement Supérieur et de Recherche co-fondée et co-dirigée par UniLaSalle (Karine LAVAL) vise à fédérer les disciplines en sciences végétales et agronomiques en Normandie pour générer de nouvelles collaborations basées sur des compétences uniques et complémentaires, renforcer la lisibilité nationale et internationale des unités constituantes et augmenter l’attractivité du territoire normand.

Les compétences des chercheurs de la SFR NORVEGE couvrent des champs disciplinaires allant de la biologie végétale à l’agronomie en passant par la microbiologie, la biochimie, la physico-chimie, l’écologie et l’économie. La SFR favorise une recherche pluridisciplinaire dans le domaine de l’agro-écologie, la nutrition et la santé des plantes, en focalisant ses activités sur les relations plantes-sols-microorganismes et s’appuie sur la technologie de la Station Expérimentale Normand Serre pour la réalisation de ses programmes de recherche.
 
5 unités de recherche sur le territoire normand dont l’unité AGHYLE campus Rouen, soit une centaine de chercheurs, doctorants et post-doctorants sont ainsi fédérés avec comme objectifs :

  1. le développement de solutions agronomiques innovantes favorisant l’économie des intrants et l’utilisation des produits et des méthodes de biocontrôle pour une protection intégrée des cultures (Plans Ecophyto Et Produire autrement du MAA)
  2. la valorisation des ressources agronomiques

Tout en favorisant les collaborations scientifiques avec des partenaires aussi bien académiques qu’issus du monde socio-économique.

La SFR communique chaque année sur les programmes soutenus au sein de ses équipes  au travers d’une Journée scientifique dédiée : La Journée de la SFR Normandie Végétale organisée à tour de rôle par l’Université de Rouen, l’Université de Caen et UniLaSalle.  

Visiter le site web

Plus d'infos sur la Journée de la SFR

Le RMT « BouclageS : Bouclage des cycles biogéochimiques et qualité des Sols » réunit 48 partenaires qui s'engagent collectivement à développer des connaissances actionnables et des outils pour soutenir une agriculture durable et résiliente. Face aux urgences du changement climatique et de la dégradation des sols, amplifiées par la flambée des prix des intrants, le RMT vise à mieux boucler les cycles biogéochimiques et à préserver la qualité des sols. Le programme de travail s'articule autour de deux axes thématiques en interaction :

  • améliorer le fonctionnement du système sol-plante en permettant une alimentation adaptée des cultures, en préservant la fertilité et en favorisant l'expression des fonctions écologiques des sols ;
  • limiter les émissions vers l'environnement, notamment de nitrate et de phosphate vers l'eau, et d'ammoniac et de protoxyde d'azote vers l'atmosphère, tout en favorisant le stockage additionnel de carbone dans le sol. Les travaux privilégient les pratiques agroécologiques de diversification des systèmes (recyclage de matières organiques, diversification des cultures, insertion de légumineuses).

Le RMT produit et diffuse des références, indicateurs, méthodes et outils d'aide à la décision pour les conseillers agricoles, les décideurs publics et les acteurs de l'enseignement agricole, facilitant ainsi l'appropriation de ces bonnes pratiques et la prise de décisions éclairées.

Visiter le site web

RMT Holopilot : Pour des Agrosystèmes Productifs, Durables et Résilients Grâce à la prise en compte et la régulation des microbiotes pilotés

L’holobionte est l’unité d’organisation biologique constituée d’un macro-organisme hôte et de son microbiote. La plante est considérée comme un holobionte. Le postulat de départ du RMT HoloPilot est qu’il est aujourd’hui essentiel de mieux comprendre l’effet des pratiques agronomiques sur la structuration de la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes, et la manière dont la plante façonne cette diversité pour constituer l’holobionte végétal – dans les compartiments racinaires comme aériens. 

Cette compréhension doit permettre la définition d’indicateurs opérationnels de diversité, de fonction ou de services rendus, qui seront agrégés dans des référentiels ouverts et partagés. L’enjeu est d’équilibrer les communautés microbiennes vers des configurations bénéfiques à la santé des sols et à la performance des cultures, dans une logique de pilotage écologique des microbiotes au sein des agroécosystèmes. L’objectif final est de concevoir des agrosystèmes productifs, économes en intrants, robustes et résilients face aux changements globaux. 

Le RMT HoloPilot y contribuera : 

  • en fédérant et structurant la communauté scientifique et technique ;
  • en décloisonnant les travaux des disciplines concernées ;
  • en favorisant les échanges entre acteurs académiques, du développement agricole et de la formation. 

Le RMT HoloPilot est centré sur les plantes d’intérêt agronomique et concerne de nombreuses filières agricoles (grandes cultures, vignes, arboricultures, maraîchage, plantes ornementales…)

RMT Sols et territoires : Sols et territoires : connecter, valoriser, former

Par sa multifonctionnalité, le sol joue un rôle central dans les enjeux de gestion durable des territoires, au-delà de la seule production agricole et de la sécurité alimentaire. Une diversité d’acteurs (ex: aménageurs, conseillers, collectivités, associations) a besoin de mobiliser des informations relatives aux sols pour aborder les enjeux agricoles, forestiers, sanitaires et environnementaux. 

Cela implique une mobilisation de la connaissance des sols et sa traduction en fonctions des sols, à différents niveaux de résolution spatiale, sur des territoires d’étendues variées. Selon l’échelle étudiée et les fonctions questionnées, des nouvelles acquisitions de données sont nécessaires pour compléter les informations déjà disponibles. 

Le RMT Sols et Territoires agira pour une meilleure connaissance des sols et de leur multifonctionnalité en facilitant l’acquisition, l’accès et l’utilisation de l’information sur les sols par les acteurs des territoires. Il viendra appuyer les politiques publiques et contribuer à la formation des nouvelles générations en promouvant notamment le dispositif «Experts associés de l’enseignement agricole». 

À travers les différentes actions proposées et en lien avec d’autres réseaux et des programmes de recherche européens, le RMT Sols et Territoires amplifiera son animation du réseau d’acteurs de la connaissance des sols pour créer une chaîne cohérente d’expertise à toutes les échelles et le maintien sur les territoires d’une expertise pédologique.

Contactez-nous !

Isabelle TRINSOUTROT-GATTIN
Directrice de l’unité AGHYLE
Stéphane FIRMIN
Directeur adjoint de l’unité AGHYLE